В соответствии с  действующим «Положением о рабочем времени и времени отдыха работников плавающего состава судов морского флота», утвержденного постановлением Министерства труда Российской Федерации от 20.02.1996 г. № 11, максимальная продолжительность работы членов экипажей на судах между двумя периодами отдыха на берегу (нахождение в отпуске, использование суммированных дней отдыха) не должна превышать 120 календарных дней. В случаях затруднения со сменой  всего экипажа или отдельных его членов в иностранных или арктических портах, задержки судна в рейсе, стоянки в порту, где смена экипажа связана со значительными затратами средств и времени, продолжительность работы на судне экипажа или отдельных его членов может быть увеличена до 150 календарных  дней.

Как следует из Вашего сообщения, данные нормы предусмотрены в трудовом договоре, заключенным с Вами работодателем. Соответственно, Вы имеете право требовать от работодателя (судовладельца) их выполнения. В данном случае отказ работодателя (судовладельца) неправомочен.

Российским трудовым законодательством предусмотрены основные способы защиты трудовых прав и свобод работников:

самозащита работниками трудовых прав;

защита трудовых прав и законных интересов работников профессиональными союзами;

государственный контроль (надзор) за соблюдением трудового законодательства и иных нормативных правовых актов, содержащих нормы трудового права;

судебная защита.

Обращаем Ваше внимание, что самозащита работников в случае нарушения их трудовых прав, предусмотренная статьей 379 ТК РФ устанавливает, что в целях самозащиты трудовых прав работник, известив работодателя или своего непосредственного руководителя либо иного представителя работодателя в письменной форме, может отказаться от выполнения работы, не предусмотренной трудовым договором, а также отказаться от выполнения работы, которая непосредственно угрожает его жизни и здоровью, за исключением случаев, предусмотренных Кодексом и иными федеральными законами. На время отказа от указанной работы за работником сохраняются все права, предусмотренные трудовым законодательством и иными актами, содержащими нормы трудового права.

Таким образом, Вы вправе покинуть борт судна и вернуться к месту проживания или иному, выбранному Вами месту, после письменного уведомления работодателя (судовладельца) о невозможности продолжать исполнять трудовые обязанности в связи с превышением установленного срока непрерывного пребывания на борту судна.

Однако правомерность этого  способа  защиты прав работников еще не подтверждена  достаточной судебной практикой, тем более в таких специфических секторах экономики, как морское судоходство с его требованиями по безопасности мореплавания.

В этой связи, рекомендуем Вам воспользоваться другими способами защиты. А именно, обратиться с жалобой  в территориальное подразделение Федеральной инспекции труда в соответствующем субъекте РФ, либо в местные органы прокуратуры, либо в суд. В любом случае, рекомендуем Вам защищать свое нарушенное право на труд через посредничество профсоюза, членом  которого  Вы являетесь, поскольку при этом Вам будет оказываться необходимая методическая и практическая помощь в форме юридического сопровождения.